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Pandora évolue dans le système Alpha Centauri à 4,4 années lumière de la Terre. Alpha Centauri est le système stellaire le plus proche de nous. Le soleil qui éclaire Pandora se nomme Alpha Centauri A (ACA). Pandora est la cinquième lune de Polyphemus, une planète gazeuse légèrement plus petite que Saturne et a quatorze lunes. L'atmosphère de Pandora est toxique pour les humains. Une partie de la surface de Pandora est recouverte par une gigantesque fôret tropicale.
Tout organisme vivant sur Pandora a des propriétés bioluminescentes qui font resplendir la nuit. La bioluminescence est produite par réaction chimique au sein d'organismes indigènes et parfois émanant des corps d'organismes vivant à l'intérieur d'eux. La bioluminescence de Pandora est suffisament puissante pour qu'elle soit visible par une navette spatiale en orbite.
Selon les scientifiques, la nature de Pandora évolue et communique tels un système nerveux, ce qui impliquerait un lien symbiotique entre tout ce qui vit. La meilleure illustration de ce lien ce sont peut-être les Woodsprites, les graines d'Utraya Mokri : l'Arbre des Ames. Un arbre sacré pour les Na'vis. Ils croient qu'il relie intimement toutes les formes de vie.